Исходный запрос:

ВЫБРАТЬ
	ОстатокДолгаОстаткиИОбороты.Период КАК Период,
	КОЛИЧЕСТВО(РАЗЛИЧНЫЕ ОстатокДолгаОстаткиИОбороты.УчетноеДело) КАК ЧислоДел
ИЗ
	РегистрНакопления.ОстатокДолга.ОстаткиИОбороты(
			&ДатаНачала, &ДатаОкончания, Месяц,	,
			НЕ УчетноеДело.ПометкаУдаления
				И УчетноеДело.ДоговорКПК.ПрограммаСубсидий = &Программа)) КАК ОстатокДолгаОстаткиИОбороты
ГДЕ
	ОстатокДолгаОстаткиИОбороты.СуммаКонечныйОстаток > 0
СГРУППИРОВАТЬ ПО
	ОстатокДолгаОстаткиИОбороты.Период
	
дает для диапазона 01.10.14 - 31.12.14 результат:
Период	ЧислоДел
01.12.2014 0:00:00	1 559
01.11.2014 0:00:00	1 510
01.10.2014 0:00:00	1 559

Результат неверный в строке ноября, т.к. я знаю, что при заданном отборе число дел может только уменьшаться. 

Проверочный запрос (исходная выборака не группируется, а соединяется сама с собой по соседним периодам, чтобы увидеть, что потерялось):

ВЫБРАТЬ
	ОстатокДолгаОстаткиИОбороты.Период КАК Период,
	ОстатокДолгаОстаткиИОбороты.УчетноеДело КАК Дело,
	ОстатокДолгаОстаткиИОбороты.СуммаОборот,
	ОстатокДолгаОстаткиИОбороты.СуммаКонечныйОстаток
ПОМЕСТИТЬ ВТ_АктуальныеДела
ИЗ
	РегистрНакопления.ОстатокДолга.ОстаткиИОбороты(
			&ДатаНачала, &ДатаОкончания, Месяц, ,
			НЕ УчетноеДело.ПометкаУдаления
				И УчетноеДело.ДоговорКПК.ПрограммаСубсидий = &Программа)) КАК ОстатокДолгаОстаткиИОбороты
ГДЕ
	ОстатокДолгаОстаткиИОбороты.СуммаКонечныйОстаток > 0
;

////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
ВЫБРАТЬ
	ВТ_АктуальныеДела.Период КАК Период,
	ВТ_АктуальныеДела.Дело,
	ВТ_АктуальныеДела.СуммаОборот,
	ЕСТЬNULL(ВТ_АктуальныеДела.СуммаКонечныйОстаток, 0) КАК КонечныйОстаток,
	ЕСТЬNULL(ВТ_АктуальныеДела1.Период, "") КАК ПредыдущийПериод,
	ЕСТЬNULL(ВТ_АктуальныеДела1.СуммаОборот, 0) КАК СуммаОборот1,
	ЕСТЬNULL(ВТ_АктуальныеДела1.СуммаКонечныйОстаток, 0) КАК КонечныйОстаток1,
	ЕСТЬNULL(ВТ_АктуальныеДела2.Период, "") КАК ПредПредыдущийПериод,
	ЕСТЬNULL(ВТ_АктуальныеДела2.СуммаОборот, 0) КАК СуммаОборот2,
	ЕСТЬNULL(ВТ_АктуальныеДела2.СуммаКонечныйОстаток, 0) КАК КонечныйОстаток2
ИЗ
	ВТ_АктуальныеДела КАК ВТ_АктуальныеДела
		ЛЕВОЕ СОЕДИНЕНИЕ ВТ_АктуальныеДела КАК ВТ_АктуальныеДела1
		ПО ВТ_АктуальныеДела.Дело = ВТ_АктуальныеДела1.Дело
			И (МЕСЯЦ(ВТ_АктуальныеДела.Период) = МЕСЯЦ(ВТ_АктуальныеДела1.Период) + 1)
		ЛЕВОЕ СОЕДИНЕНИЕ ВТ_АктуальныеДела КАК ВТ_АктуальныеДела2
		ПО ВТ_АктуальныеДела.Дело = ВТ_АктуальныеДела2.Дело
			И (МЕСЯЦ(ВТ_АктуальныеДела.Период) = МЕСЯЦ(ВТ_АктуальныеДела2.Период) + 2)
ГДЕ
	МЕСЯЦ(ВТ_АктуальныеДела.Период) = МЕСЯЦ(&ДатаНачала) + 2